El Colegio de Docentes es un órgano dedicado a planificar, coordinar y decidir sobre los aspectos docentes y académicos del Doctorado. Entre sus principales funciones está el participar en la estructuración de los programas de los seminarios, en la formulación de nuevos seminarios y dar seguimiento formal a los proyectos de las y de los estudiantes.
El Colegio está presidido por el Coordinador del programa y está integrado por un núcleo básico de docentes:
1. Carlos Guevara Meza (Coordinador)
2. Rocío Judith Galicia Velasco
3. Arturo Díaz Sandoval
4. Luis Jaime Cortez Méndez
5. María de Lourdes Fernández Serratos
6. Javier Contreras Villaseñor
7. Andrea Margarita Tortajada Quiroz
8. Irma Fuentes Mata
9. Pablo Alberto Tepichín Jasso
10. Martha Eugenia Alfaro Cuevas
11. Norma Yhared Lago Cázares (Niña Yhared)
12. Iracema de Andrade Almeida
13. Hilda del Carmen Islas Licona
14. Paloma Macías Guzmán
15. Alfredo Gurza González
16. Claudia Cabrera Sánchez